20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7759 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7759  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  325  2e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00223773  normal  0.120642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  37.42 
 
 
207 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  37.82 
 
 
207 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  38.89 
 
 
219 aa  78.6  4e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  38.89 
 
 
219 aa  78.6  4e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  35.48 
 
 
208 aa  75.1  4e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  35.85 
 
 
220 aa  70.5  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  32.9 
 
 
208 aa  62  4e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  29.19 
 
 
203 aa  52.4  3e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  29.49 
 
 
182 aa  51.2  7e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  30.25 
 
 
203 aa  50.8  9e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  30.25 
 
 
203 aa  50.1  1e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  34.64 
 
 
179 aa  50.1  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  28.7 
 
 
204 aa  48.1  6e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  34.19 
 
 
190 aa  47.8  7e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  33.7 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  30.97 
 
 
417 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  32.41 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  28.67 
 
 
186 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  32.43 
 
 
207 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>