20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7759 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7759  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  325  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00223773  normal  0.120642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  37.42 
 
 		 207 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  37.82 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  38.89 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  38.89 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  35.48 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  35.85 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  32.9 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  29.19 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  29.49 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  30.25 
 
 		 203 aa  50.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  30.25 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  34.64 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  28.7 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  34.19 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  33.7 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  30.97 
 
 		 417 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  32.41 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  28.67 
 
 		 186 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  32.43 
 
 		 207 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>