More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6111 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  78.54 
 
 
265 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  75.58 
 
 
266 aa  404  1e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  76.65 
 
 
268 aa  394  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  72.14 
 
 
263 aa  391  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  74.03 
 
 
272 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  70.23 
 
 
263 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3569  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  69.73 
 
 
270 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.6 
 
 
261 aa  355  6e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.46 
 
 
259 aa  344  9e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  63.85 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.69 
 
 
259 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  62.69 
 
 
259 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  62.55 
 
 
258 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  62.55 
 
 
258 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  62.55 
 
 
261 aa  336  2e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  61.78 
 
 
262 aa  336  2e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.55 
 
 
261 aa  335  3e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  62.02 
 
 
265 aa  335  6e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.69 
 
 
266 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  61.78 
 
 
261 aa  328  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  63.32 
 
 
259 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  59.69 
 
 
258 aa  327  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.92 
 
 
292 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  59.85 
 
 
290 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  59.85 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  59.85 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  59.85 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  59.85 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  59.85 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.15 
 
 
265 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  59.46 
 
 
258 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.54 
 
 
259 aa  315  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.85 
 
 
259 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  58.85 
 
 
259 aa  308  7e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.31 
 
 
259 aa  307  1e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.9 
 
 
272 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  50.96 
 
 
266 aa  242  4e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.49 
 
 
256 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  46.29 
 
 
233 aa  197  1e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  45.73 
 
 
235 aa  197  2e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  45.3 
 
 
235 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.15 
 
 
234 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.31 
 
 
238 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19550  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  44.07 
 
 
265 aa  171  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.36 
 
 
237 aa  165  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  38.36 
 
 
213 aa  163  2e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17880  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  41.18 
 
 
264 aa  163  2e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.615091  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2859  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 
290 aa  162  5e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.37 
 
 
249 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  38.67 
 
 
222 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.83 
 
 
244 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.02 
 
 
232 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  41.85 
 
 
222 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0109  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.43 
 
 
223 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  36.4 
 
 
200 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2429  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
255 aa  112  8e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.391574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3978  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.09 
 
 
259 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00187399  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  38.28 
 
 
193 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
194 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
193 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.5 
 
 
193 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.5 
 
 
193 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.72 
 
 
193 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  36.72 
 
 
193 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.72 
 
 
193 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.01 
 
 
193 aa  99  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.72 
 
 
193 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
192 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.72 
 
 
193 aa  98.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 
193 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.49 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2434  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.22 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.67 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  34.84 
 
 
198 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  30.73 
 
 
201 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.54354e-09  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4702  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.97 
 
 
203 aa  80.9  2e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.510375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.96 
 
 
196 aa  79.7  4e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.2 
 
 
222 aa  79.7  5e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
197 aa  79.3  6e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.8 
 
 
198 aa  79.3  6e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  32.46 
 
 
203 aa  79  7e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.49 
 
 
197 aa  77.8  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 
198 aa  77.8  2e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.57 
 
 
176 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0048  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  27.57 
 
 
176 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein  27.57 
 
 
176 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0052  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  27.57 
 
 
176 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00049  hypothetical protein  27.57 
 
 
176 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  27.57 
 
 
176 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.72 
 
 
191 aa  76.3  5e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  27.57 
 
 
176 aa  75.9  6e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 
196 aa  75.5  8e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3486  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.97 
 
 
183 aa  75.5  8e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1809  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
185 aa  75.5  8e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.664147  normal  0.0637003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.82 
 
 
198 aa  75.5  9e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.71 
 
 
200 aa  75.1  1e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 
195 aa  75.1  1e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3609  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  27.57 
 
 
176 aa  74.7  1e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0040  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  27.57 
 
 
176 aa  74.7  1e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>