35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  228  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  69.75 
 
 		 121 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  67.52 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  65.77 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  69.75 
 
 		 123 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  57.76 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  57.98 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  63.54 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  72 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  47.9 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  59.8 
 
 		 125 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  48.74 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  59.66 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  59.66 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  52.1 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  53.45 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  47.9 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  59.66 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  61.34 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  44.07 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  40.34 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  38.94 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  38.32 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  37.11 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  32.67 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  41.24 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  38.82 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  29.91 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  34.02 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  33.7 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  32.77 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  33.07 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  33.07 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  36.05 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>