More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5391 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5391  sulfate ABC transporter permease protein CysW  100 
 
 
289 aa  572  1e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2074  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  74.18 
 
 
277 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  6.41396e-23 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2959  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.06 
 
 
297 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  69.62 
 
 
293 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0122  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  77.98 
 
 
294 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0109  sulfate ABC transporter, permease protein  76.04 
 
 
288 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0106  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  76.04 
 
 
288 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0125  ABC type transporter  69.68 
 
 
304 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  3.64812e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0558  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.45 
 
 
300 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1377  sulfate ABC transporter permease protein CysW  74.91 
 
 
305 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0594  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  71.03 
 
 
300 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1285  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.05 
 
 
328 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1222  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.7 
 
 
326 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.917674  normal  0.204361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0583  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.45 
 
 
300 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.501211  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1545  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  69.34 
 
 
302 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1969  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  73.82 
 
 
307 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2378  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  67.6 
 
 
339 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4542  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.68 
 
 
288 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1079  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.66 
 
 
292 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.871457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2064  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.76 
 
 
291 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3558  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  68.84 
 
 
292 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6757  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.07 
 
 
290 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52576  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1346  putative sulfate transport ABC transporter protein  70.21 
 
 
326 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525914  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5845  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.76 
 
 
290 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4588  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  70.22 
 
 
335 aa  361  9e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0610  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  69.92 
 
 
298 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1775  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  71.69 
 
 
350 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0521176  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2468  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysW  71.69 
 
 
346 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579343  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4741  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.53 
 
 
316 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00402264  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1392  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  71.91 
 
 
307 aa  357  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1499  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.53 
 
 
315 aa  357  1e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1519  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.53 
 
 
315 aa  357  1e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172218  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1580  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  74.47 
 
 
314 aa  356  2e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43573  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3892  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  68.98 
 
 
294 aa  356  2e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441604  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1182  sulfate ABC transporter, permease protein  70.29 
 
 
295 aa  356  2e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.27298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1603  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  74.47 
 
 
314 aa  356  3e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1123  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  74.47 
 
 
314 aa  356  3e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6975  sulfate/thiosulfate permease W  69.78 
 
 
301 aa  355  6e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2547  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.13 
 
 
315 aa  354  9e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1634  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  73.62 
 
 
315 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0731  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.67 
 
 
283 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4008  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  71 
 
 
298 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3402  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  70.63 
 
 
297 aa  348  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0309805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5169  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  70.76 
 
 
290 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2533  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.66 
 
 
294 aa  348  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00678647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3806  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  68.9 
 
 
337 aa  348  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.742669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1640  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.66 
 
 
319 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259928  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5229  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  70.34 
 
 
290 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.587413  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  70.34 
 
 
290 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.500562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4654  sulfate ABC transporter, permease protein  63.84 
 
 
283 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1521  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  67.94 
 
 
303 aa  345  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.561471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03670  sulfate transport protein CysW  67.56 
 
 
289 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0616363  hitchhiker  6.87295e-09 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1904  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  70.85 
 
 
278 aa  345  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.47228e-07  hitchhiker  1.52704e-11 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1047  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  69.93 
 
 
306 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0868  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.18 
 
 
332 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1627  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  70.59 
 
 
334 aa  344  9e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.486831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1348  sulfate ABC transporter, permease protein  72.59 
 
 
276 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1198  sulfate ABC transporter, permease protein  64.31 
 
 
285 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1158  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  70.74 
 
 
305 aa  343  3e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1127  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  63.94 
 
 
285 aa  343  3e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5076  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  69.92 
 
 
290 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.10666  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0310  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  67.77 
 
 
290 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2336  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  67.94 
 
 
303 aa  342  6e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.131408  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2758  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  67.99 
 
 
289 aa  341  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2478  sulfate ABC transporter, permease protein  74.04 
 
 
340 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0082  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.36 
 
 
290 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.518926  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1797  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.13 
 
 
292 aa  339  3e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0541213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2016  sulfate transport system permease protein  74.04 
 
 
344 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1849  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  74.04 
 
 
348 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1863  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  74.04 
 
 
344 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3092  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.74 
 
 
293 aa  338  6e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.91 
 
 
285 aa  337  1e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5477  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  70.9 
 
 
285 aa  337  1e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0808  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  73.62 
 
 
352 aa  337  2e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1207  sulfate ABC transporter, permease protein  73.62 
 
 
292 aa  337  2e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1696  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  73.62 
 
 
352 aa  337  2e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0434814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0352  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  73.62 
 
 
348 aa  337  2e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.387041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1760  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  72.02 
 
 
288 aa  336  3e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2108  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.1 
 
 
312 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.464713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4347  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  68.46 
 
 
290 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0504  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  68.98 
 
 
293 aa  332  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2198  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.64 
 
 
283 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31740  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  68.1 
 
 
290 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0196  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  70.37 
 
 
290 aa  329  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0372  sulfate transport protein CysW  67.94 
 
 
288 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  69.72 
 
 
306 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.31 
 
 
293 aa  328  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4116  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.45 
 
 
286 aa  327  1e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.943743  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1135  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.36 
 
 
312 aa  327  2e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1554  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60.67 
 
 
289 aa  325  4e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0819  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  71.27 
 
 
304 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4342  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.29 
 
 
297 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1738  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  67.03 
 
 
293 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0623  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  72.39 
 
 
302 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1388  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.57 
 
 
310 aa  322  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3691  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.81 
 
 
287 aa  319  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2194  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  66.19 
 
 
286 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908554  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3313  ABC transporter related protein  62.86 
 
 
283 aa  318  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857976  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1073  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysW  57.37 
 
 
310 aa  315  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0403376  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2801  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.12 
 
 
294 aa  313  2e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>