More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2798 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  64.06 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2530  aldo/keto reductase  63.21 
 
 		 282 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  65 
 
 		 282 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  55.16 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.72 
 
 		 277 aa  328  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  55.32 
 
 		 282 aa  328  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  57.61 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  55.11 
 
 		 277 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  54.18 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4255  aldo/keto reductase  55.47 
 
 		 278 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53850  oxidoreductase  53.96 
 
 		 273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.74 
 
 		 281 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  51.25 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  51.25 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  55.11 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  52.16 
 
 		 273 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  51.25 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  51.6 
 
 		 281 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  51.25 
 
 		 281 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  50.89 
 
 		 281 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 		 286 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 		 281 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  55.47 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  52.31 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.02 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.02 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.02 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  51.96 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  54.38 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  52.4 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1775  aldo/keto reductase  52.79 
 
 		 276 aa  299  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360255  normal  0.42247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2596  aldo/keto reductase  52.03 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  52.4 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.6 
 
 		 281 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  50.18 
 
 		 283 aa  295  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  48.21 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  50.86 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  48.57 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  50.53 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  51.44 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3700  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.03 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1775  aldo/keto reductase  52.03 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.316569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  50.92 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  47.67 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3120  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.14 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00828042  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  46.29 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.1 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  47.46 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  47.46 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  47.46 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  47.46 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.46 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.45 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.45 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.45 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.45 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.46 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.1 
 
 		 284 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.1 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.74 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3502  aldo/keto reductase  55.47 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0118394  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1256  aldo/keto reductase  53.62 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1860  aldo/keto reductase  48.15 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000397966  hitchhiker  0.000000000147499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  48.4 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  45.36 
 
 		 294 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 284 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  47.13 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  45.22 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  46.35 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3345  aldo/keto reductase  46.07 
 
 		 300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3942  aldo/keto reductase  48.76 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0842861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  46.98 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  46.55 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2893  aldo/keto reductase  44.52 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  48.73 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3254  aldo/keto reductase  46.84 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2211  aldo/keto reductase  46.84 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684458  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  44.36 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2442  aldo/keto reductase  45.83 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  41.7 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1806  aldo/keto reductase  39.33 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.155578 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  39.85 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  39.85 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1557  aldo/keto reductase  38.72 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  35.85 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1630  aldo/keto reductase  40 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1578  aldo/keto reductase  37.76 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0586561  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0946  aldo/keto reductase  33.07 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.837346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  38.6 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0489  aldo/keto reductase  37.29 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0944  aldo/keto reductase  35.8 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0593  aldo/keto reductase  36.02 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000835001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  32.99 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  36.18 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  37.16 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0452  aldo/keto reductase  33.07 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  34.94 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  34.33 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>