More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2211 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2211  aldo/keto reductase  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684458  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3254  aldo/keto reductase  92.88 
 
 		 281 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2442  aldo/keto reductase  83.99 
 
 		 281 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  77.54 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  70.5 
 
 		 279 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  74.28 
 
 		 279 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  70.14 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  67.63 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  63.41 
 
 		 279 aa  331  9e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  60 
 
 		 275 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  56.36 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  51.09 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2530  aldo/keto reductase  53.24 
 
 		 282 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  50.72 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  52.99 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.36 
 
 		 277 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  50.95 
 
 		 284 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4255  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 278 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  52.35 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53850  oxidoreductase  52.99 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  50.58 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  52.79 
 
 		 273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  51.82 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.82 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  46.91 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.91 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.27 
 
 		 284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  46.91 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  50.58 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.91 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  51.48 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  52.01 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.91 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2596  aldo/keto reductase  49.47 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  52.27 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.91 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.91 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.91 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.91 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.91 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.27 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.27 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  46.04 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.27 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.27 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.91 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.27 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  52.27 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  52.27 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  52.27 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  51.53 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  51.52 
 
 		 281 aa  234  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  49.46 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  48.33 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  49.62 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  46.84 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  48.55 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1775  aldo/keto reductase  47.1 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360255  normal  0.42247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  45.62 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1860  aldo/keto reductase  44.49 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000397966  hitchhiker  0.000000000147499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3120  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.19 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00828042  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  48.54 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3700  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.04 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3502  aldo/keto reductase  50 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0118394  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  49.45 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1256  aldo/keto reductase  52.05 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1775  aldo/keto reductase  44.68 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.316569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3345  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  46.35 
 
 		 277 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  50.37 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2893  aldo/keto reductase  43.94 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 282 aa  205  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  47.64 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  38.22 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  39.19 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  39.19 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1578  aldo/keto reductase  37.55 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0586561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3942  aldo/keto reductase  44.85 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0842861  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  34.86 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  34.22 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0944  aldo/keto reductase  39.84 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  34.65 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0593  aldo/keto reductase  37.89 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000835001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0946  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.837346  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  38.78 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 314 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  37.02 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0452  aldo/keto reductase  35.38 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2848  aldo/keto reductase  35.98 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>