32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0017 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0017  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  302  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3951  hypothetical protein  61.9 
 
 
144 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4278  hypothetical protein  60.54 
 
 
144 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3234  hypothetical protein  61.94 
 
 
141 aa  174  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0806  hypothetical protein  58.52 
 
 
151 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0669  hypothetical protein  60.31 
 
 
138 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2030  hypothetical protein  55.07 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2114  hypothetical protein  55.07 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3712  hypothetical protein  40.91 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3311  hypothetical protein  39.71 
 
 
188 aa  98.6  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1177  hypothetical protein  42.5 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695583  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1905  hypothetical protein  40.16 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2641  hypothetical protein  41.18 
 
 
136 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1298  hypothetical protein  41.18 
 
 
136 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.675467  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3008  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  87  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0884  hypothetical protein  40.46 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789446  normal  0.18909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1084  hypothetical protein  36.03 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389203  normal  0.629559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6885  hypothetical protein  39.86 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120825  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4153  hypothetical protein  36.76 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0293602  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2973  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763953  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2721  hypothetical protein  36.51 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1806  hypothetical protein  36.3 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586351  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1305  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2709  hypothetical protein  37.6 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4757  hypothetical protein  36.64 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2936  hypothetical protein  34.53 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.0164509 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2846  hypothetical protein  36.97 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3071  hypothetical protein  38.71 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.192649  normal  0.478778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2831  hypothetical protein  36.07 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3516  hypothetical protein  36.72 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.066418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0468  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1999  hypothetical protein  36.51 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151005  normal  0.140541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>