35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3229 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  209  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2196  small multidrug resistance protein  58.56 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  38.57 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  43.33 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1265  small multidrug resistance protein  30.38 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  32.26 
 
 
123 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  33.06 
 
 
123 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  32.26 
 
 
123 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  32.26 
 
 
123 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  32.26 
 
 
123 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  32.5 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  33.03 
 
 
114 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  33.06 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  33.03 
 
 
114 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  32.26 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  32.26 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  31.45 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.04 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  32.99 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  32.63 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  32.17 
 
 
123 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  28.28 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  29.29 
 
 
117 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  31.96 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  30.51 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  31.96 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>