89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0259 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  100 
 
 
162 aa  323  6e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1438  MOSC domain containing protein  60.29 
 
 
146 aa  165  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  58.87 
 
 
262 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  57.45 
 
 
152 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  58.99 
 
 
146 aa  163  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  54.61 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  56.34 
 
 
145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  56.83 
 
 
144 aa  157  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  51.77 
 
 
143 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  55.15 
 
 
143 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  51.77 
 
 
143 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  49.67 
 
 
154 aa  153  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  52.45 
 
 
158 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  52.9 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  51.45 
 
 
143 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  56.64 
 
 
144 aa  147  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  51.01 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  51.8 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  54.23 
 
 
147 aa  145  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  52.11 
 
 
146 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  53.24 
 
 
145 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  50 
 
 
147 aa  141  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  51.41 
 
 
145 aa  141  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01830  hypothetical protein  52.45 
 
 
177 aa  140  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  51.77 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  50.35 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10950  hypothetical protein  45.45 
 
 
180 aa  137  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00746491  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  50 
 
 
142 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  50.74 
 
 
142 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  46.15 
 
 
154 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2768  MOSC domain containing protein  53.15 
 
 
144 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  50.69 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  49.65 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  43.45 
 
 
310 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  47.52 
 
 
144 aa  133  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  52.94 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  53.52 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  42.75 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  51.09 
 
 
144 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0733  MOSC domain-containing protein  52.21 
 
 
152 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  45.75 
 
 
156 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  48.3 
 
 
308 aa  124  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1545  hypothetical protein  49.64 
 
 
146 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695091  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  44.9 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  47.06 
 
 
148 aa  117  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  46.72 
 
 
149 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1858  MOSC domain-containing protein  40.69 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  38 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  38.78 
 
 
144 aa  96.3  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0654  MOSC domain-containing protein  30.99 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000905439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0397  hypothetical protein  37.67 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  31.33 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  28.4 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  32.54 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1607  MOSC  29.01 
 
 
204 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  32.73 
 
 
184 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  30.43 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  32.19 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  33.9 
 
 
190 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  30.61 
 
 
179 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  34.48 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  31.72 
 
 
142 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4395  MOSC domain containing protein  31.65 
 
 
209 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772534  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  27.7 
 
 
226 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  27.56 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  28 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  29.22 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000026195  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4075  MOSC domain containing protein  29.87 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  26.71 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  26.06 
 
 
209 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  29.05 
 
 
233 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  29.58 
 
 
549 aa  43.9  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  34.12 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2108  MOSC domain-containing protein  26.57 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  27.54 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  30.28 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  29.32 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  25 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  30.83 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  28.08 
 
 
226 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  30.83 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  28.97 
 
 
214 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  28.78 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  30.71 
 
 
209 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  30.83 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9197  hypothetical protein  32.82 
 
 
223 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2352  MOSC domain containing protein  32.54 
 
 
216 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  27.46 
 
 
229 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  29.06 
 
 
205 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>