38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2247 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2247  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  866    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.310158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1567  hypothetical protein  63 
 
 
447 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2296  hypothetical protein  62.18 
 
 
448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.744575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2384  hypothetical protein  62.09 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1905  hypothetical protein  44.29 
 
 
505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2973  hypothetical protein  42.79 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000455039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0905  hypothetical protein  34.95 
 
 
451 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1184  hypothetical protein  34.64 
 
 
410 aa  203  5e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4602  hypothetical protein  32.42 
 
 
392 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3120  phosphate-selective porin O and P  32.58 
 
 
390 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000046634  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1315  putative signal peptide protein  33.05 
 
 
372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000348515  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_0589  phosphate-selective porin O and P  31.74 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000499281  unclonable  0.0000111386 
 
 
-
 
NC_003296  RS01730  putative signal peptide protein  29.47 
 
 
457 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2014  phosphate-selective porin O and P  32.39 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.637056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4035  phosphate-selective porin O and P  31.81 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1559  phosphate-selective porin O and P  28.76 
 
 
458 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1888  phosphate-selective porin O and P  28.76 
 
 
458 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00748844  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3788  phosphate-selective porin O and P  32.95 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000264942  decreased coverage  0.00000068158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3889  phosphate-selective porin O and P  32.67 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000019269  decreased coverage  0.000370882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0712  phosphate-selective porin O and P  32.1 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000988796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2437  hypothetical protein  30.36 
 
 
398 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306411  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0706  putative signal peptide protein  30.77 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.278446  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0447  hypothetical protein  31.28 
 
 
413 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0425  hypothetical protein  31.82 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000166547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0638  phosphate-selective porin O and P  31.14 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000222961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2944  hypothetical protein  28.57 
 
 
420 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140156  hitchhiker  0.0032138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0936  hypothetical protein  27.81 
 
 
468 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0970  hypothetical protein  27.55 
 
 
468 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000021772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0721  hypothetical protein  28.8 
 
 
491 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0930  hypothetical protein  28.73 
 
 
419 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000108303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0810  hypothetical protein  29.2 
 
 
467 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.682214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0790  hypothetical protein  28 
 
 
461 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0675  hypothetical protein  27.64 
 
 
481 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0670  hypothetical protein  26.03 
 
 
469 aa  96.7  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3793  hypothetical protein  27.32 
 
 
465 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000178587  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0693  hypothetical protein  23.06 
 
 
454 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2608  hypothetical protein  26.28 
 
 
567 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1834  hypothetical protein  28.14 
 
 
471 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>