More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3681 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  37.57 
 
 
4968 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  37.57 
 
 
2867 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  38.63 
 
 
3942 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3681  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1142 aa  2210    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  39.7 
 
 
2448 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  38.2 
 
 
1569 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  41.95 
 
 
7712 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  39.6 
 
 
1199 aa  626  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2091  amino acid adenylation domain-containing protein  36.97 
 
 
1145 aa  629  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  39.29 
 
 
8914 aa  618  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  40.97 
 
 
4991 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  37.91 
 
 
2154 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.34 
 
 
2385 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  38.05 
 
 
2151 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.44 
 
 
2385 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  38.2 
 
 
5926 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.44 
 
 
2385 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  39.58 
 
 
2137 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  38.03 
 
 
5929 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35.34 
 
 
2385 aa  598  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  35.12 
 
 
1142 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  35.1 
 
 
2385 aa  596  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.9 
 
 
3308 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.07 
 
 
2385 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  37.47 
 
 
6081 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.38 
 
 
2385 aa  592  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.05 
 
 
2385 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  38.57 
 
 
3331 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.1 
 
 
2385 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  37.02 
 
 
6072 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  40.88 
 
 
8211 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  35.14 
 
 
2386 aa  588  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  37.99 
 
 
6176 aa  584  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  39 
 
 
3710 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  36.85 
 
 
4468 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  37.1 
 
 
4572 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  37.52 
 
 
3639 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  39.3 
 
 
2614 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.69 
 
 
9498 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.23 
 
 
3498 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  37.51 
 
 
1405 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.61 
 
 
2033 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  34.81 
 
 
2386 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  34.61 
 
 
1550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.29 
 
 
3086 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  35.35 
 
 
6202 aa  559  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 
2581 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.47 
 
 
6676 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  35.44 
 
 
2395 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.2 
 
 
3086 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  35.33 
 
 
2395 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  35.87 
 
 
1383 aa  552  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  41.36 
 
 
4106 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  34.12 
 
 
4960 aa  545  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.64 
 
 
4531 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.83 
 
 
6889 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  32.62 
 
 
1556 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.24 
 
 
4489 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.46 
 
 
4960 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  37.04 
 
 
1137 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  31.35 
 
 
2193 aa  539  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  37.63 
 
 
3002 aa  539  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  32.62 
 
 
1556 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38.27 
 
 
6403 aa  539  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 
3291 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  32.09 
 
 
2156 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.7 
 
 
2156 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  34.75 
 
 
2419 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  38.63 
 
 
5750 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.53 
 
 
2156 aa  532  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.94 
 
 
8646 aa  532  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  34.48 
 
 
1816 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.69 
 
 
2370 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  37.37 
 
 
6661 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.7 
 
 
5953 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  37.26 
 
 
8915 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  33.13 
 
 
2664 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  37 
 
 
4747 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  37.74 
 
 
3021 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  38.54 
 
 
2412 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.15 
 
 
3291 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.32 
 
 
1839 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  38.89 
 
 
4290 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  35.96 
 
 
3348 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  37.8 
 
 
3328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  32.92 
 
 
2883 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  35.09 
 
 
5738 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.03 
 
 
3176 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  37.8 
 
 
3352 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.76 
 
 
1833 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  38.14 
 
 
1083 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  31.44 
 
 
3114 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  36.78 
 
 
1776 aa  516  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  36.04 
 
 
5328 aa  515  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  37.8 
 
 
6006 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.75 
 
 
3432 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  30.77 
 
 
3235 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  33.98 
 
 
1363 aa  512  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  37.13 
 
 
3432 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  40.33 
 
 
5698 aa  512  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>