11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2413 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2413  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  360  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000208245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2415  hypothetical protein  32.58 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2114  hypothetical protein  30 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1997  hypothetical protein  28.74 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00570092  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11750  transmembrane protein  32.26 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1653  hypothetical protein  31.55 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0962873  normal  0.602883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4998  putative transmembrane protein  28.19 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3450  hypothetical protein  28.25 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5010  hypothetical protein  27.87 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3160  hypothetical protein  31.25 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0418164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1379  putative transmembrane protein  25.27 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677817  normal  0.543025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>