58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2072 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  71.91 
 
 
584 aa  805    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  100 
 
 
579 aa  1169    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  68.07 
 
 
590 aa  808    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  69.95 
 
 
602 aa  820    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  89.14 
 
 
579 aa  1046    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  69.95 
 
 
602 aa  820    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  70.34 
 
 
605 aa  811    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  68.9 
 
 
588 aa  781    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  53.71 
 
 
546 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  52.3 
 
 
545 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  49.14 
 
 
565 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  48.26 
 
 
551 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  48.53 
 
 
538 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  48.44 
 
 
538 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  48.32 
 
 
515 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  48.12 
 
 
540 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  66.1 
 
 
537 aa  462  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  68.69 
 
 
509 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  65.24 
 
 
509 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  69.03 
 
 
539 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  64.76 
 
 
335 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  66.98 
 
 
515 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  47.95 
 
 
445 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  65.25 
 
 
496 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  38.96 
 
 
322 aa  200  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  38.51 
 
 
318 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  33.33 
 
 
386 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  34.19 
 
 
322 aa  150  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  38.46 
 
 
552 aa  112  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  26.01 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  25.45 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  25.45 
 
 
294 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  29.52 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  25.46 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  25.72 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  25.09 
 
 
308 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  25.09 
 
 
308 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  24.91 
 
 
308 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  25.09 
 
 
308 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  25.09 
 
 
308 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  24.27 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  24.35 
 
 
308 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  24.35 
 
 
308 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  24.73 
 
 
307 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  30.77 
 
 
306 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  30.3 
 
 
316 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  26.59 
 
 
308 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  27.45 
 
 
331 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  28.8 
 
 
337 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  23.66 
 
 
313 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  25.11 
 
 
336 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  23.53 
 
 
350 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.94 
 
 
313 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  26.99 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  27.74 
 
 
345 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  26.9 
 
 
342 aa  47.4  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  27.34 
 
 
332 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2157  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  43.86 
 
 
199 aa  44.3  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>