More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0012 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
269 aa  543  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0013  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
269 aa  543  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0346954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0125  septum site-determining protein MinD  75.93 
 
 
271 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0085  septum site-determining protein MinD  76.3 
 
 
271 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0066  septum site-determining protein MinD  76.3 
 
 
271 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3238  septum site-determining protein MinD  76.3 
 
 
272 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.442677  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3066  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2112  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0800  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1980  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3032  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2415  septum site-determining protein MinD  74.35 
 
 
271 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2967  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3562  septum site-determining protein MinD  76.3 
 
 
273 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2632  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0856  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.866875  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0505  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.978735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0944  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0984  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3365  septum site-determining protein MIND  76.3 
 
 
271 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1570  septum site-determining protein MinD  74.72 
 
 
271 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0092  septum site-determining protein MinD  74.81 
 
 
270 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0844  septum site-determining protein MinD  74.35 
 
 
271 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4088  septum site-determining protein MinD  73.61 
 
 
271 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210489  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3424  septum site-determining protein MinD  74.35 
 
 
271 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0035  septum site-determining protein MinD  74.07 
 
 
271 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.253423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1055  septum site-determining protein MinD  73.98 
 
 
271 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0656  septum site-determining protein MinD  74.35 
 
 
271 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676446  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2035  septum site-determining protein MinD  75.75 
 
 
270 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0008  septum site-determining protein MinD  73.33 
 
 
271 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0066  septum site-determining protein MinD  73.33 
 
 
271 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0063  septum site-determining protein MinD  73.61 
 
 
271 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0276  septum site-determining protein MinD  74.81 
 
 
271 aa  417  1e-115  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0034  septum site-determining protein MinD  72.49 
 
 
270 aa  415  1e-115  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2303  septum site-determining protein MinD  75.56 
 
 
271 aa  417  1e-115  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  72.49 
 
 
270 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  73.61 
 
 
270 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1633  septum site-determining protein MinD  72.22 
 
 
272 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0019  septum site-determining protein MinD  72.32 
 
 
272 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324829  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0033  septum site-determining protein MinD  72.32 
 
 
272 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  72.12 
 
 
271 aa  404  1e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  5.94989e-14 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1974  cell division inhibitor MinD  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102785  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  73.23 
 
 
271 aa  406  1e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  72.01 
 
 
269 aa  404  1e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1319  cell division inhibitor MinD  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.02659e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1275  cell division inhibitor MinD  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.62763e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  73.61 
 
 
269 aa  404  1e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  1.29404e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
270 aa  406  1e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1931  septum site-determining protein MinD  73.13 
 
 
269 aa  406  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.72441e-06  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01150  membrane ATPase of the MinC-MinD-MinE system  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01160  hypothetical protein  73.33 
 
 
270 aa  406  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
270 aa  406  1e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1283  septum site-determining protein MinD  70.52 
 
 
270 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126659  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  73.03 
 
 
276 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2372  cell division inhibitor MinD  72.22 
 
 
270 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000838785  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1502  cell division inhibitor MinD  72.59 
 
 
270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0106864  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1694  septum site-determining protein MinD  71 
 
 
270 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  70.9 
 
 
269 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  1.28974e-06  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1318  cell division inhibitor MinD  72.59 
 
 
270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  7.03051e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  71.75 
 
 
271 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1954  cell division inhibitor MinD  72.59 
 
 
270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00226645  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1957  cell division inhibitor MinD  72.59 
 
 
270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000405698  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  73.03 
 
 
276 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2014  cell division inhibitor MinD  72.59 
 
 
270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00470279  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3873  septum site-determining protein MinD  70.63 
 
 
270 aa  399  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.748671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  397  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.53952e-08  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2007  cell division inhibitor MinD  71.85 
 
 
270 aa  399  1e-110  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  399  1e-110  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.47543e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  70.74 
 
 
276 aa  400  1e-110  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  3.80987e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  70.52 
 
 
269 aa  398  1e-110  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.42736e-08  unclonable  1.74808e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2235  cell division inhibitor MinD  71.11 
 
 
270 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  5.61907e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  70.9 
 
 
269 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.7885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  71.48 
 
 
270 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.45956e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  70.63 
 
 
277 aa  394  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3344  septum site-determining protein MinD  70 
 
 
271 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0809847  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  70.9 
 
 
269 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.84306e-08  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  70.9 
 
 
269 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.04586e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  68.77 
 
 
269 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.43693e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2757  cell division inhibitor MinD  70.74 
 
 
270 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  6.21875e-10  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1234  septum site-determining protein MinD  70.63 
 
 
271 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246291  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  70.37 
 
 
270 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  72.01 
 
 
269 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  70.37 
 
 
270 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.76634e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.45291e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  70.9 
 
 
269 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.062e-07  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  70.37 
 
 
270 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.62296e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  70.74 
 
 
270 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1837  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1628  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.84278e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  71.27 
 
 
269 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.78028e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1165  septum site-determining protein MinD  71 
 
 
270 aa  391  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  5.37171e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1364  septum site-determining protein MinD  71.38 
 
 
271 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  69.89 
 
 
272 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1612  septum site-determining protein MinD  69.89 
 
 
270 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00643531  normal  0.221579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>