5121 genes were found for organism Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cyan7425_0198  CDS  NC_011884  48  1430  1383  chromosomal replication initiation protein  YP_002480955  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0199  CDS  NC_011884  1922  3046  1125  DNA polymerase III subunit beta  YP_002480956  decreased coverage  5.79402e-05  normal  0.0770055  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0200  CDS  NC_011884  3553  3723  171  hypothetical protein  YP_002480957  decreased coverage  7.73522e-05  normal  0.0971203  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0201  CDS  NC_011884  4274  5620  1347  glutamine synthetase catalytic region  YP_002480958  normal  0.0281454  normal  0.125698  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0202  CDS  NC_011884  5620  6747  1128  amidohydrolase 2  YP_002480959  normal  0.0402024  normal  0.174802  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0203  CDS  NC_011884  6680  7993  1314  GAF sensor signal transduction histidine kinase  YP_002480960  normal  0.210303  normal  0.186163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0204  CDS  NC_011884  8218  9534  1317  hypothetical protein  YP_002480961  normal  0.0209978  normal  0.189002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0205  CDS  NC_011884  9696  10310  615  hypothetical protein  YP_002480962  normal  0.247949  normal  0.166868  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0206  CDS  NC_011884  10567  12102  1536  anthranilate synthase component I  YP_002480963  normal  0.442563  normal  0.201445  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0207  CDS  NC_011884  12184  12840  657  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_002480964  normal  normal  0.163925  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0208  CDS  NC_011884  12892  13500  609  hypothetical protein  YP_002480965  normal  normal  0.16619  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0209  CDS  NC_011884  13525  13980  456  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002480966  normal  normal  0.164489  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0210  CDS  NC_011884  14133  15236  1104  radical SAM enzyme, Cfr family  YP_002480967  normal  normal  0.128689  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0211  CDS  NC_011884  15386  16462  1077  GDP-mannose 4,6-dehydratase  YP_002480968  normal  normal  0.140202  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0212  CDS  NC_011884  16466  17410  945  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002480969  normal  0.198534  normal  0.135614  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0213  CDS  NC_011884  17477  19699  2223  helicase, RecD/TraA family  YP_002480970  normal  0.629499  normal  0.0445082  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0214  CDS  NC_011884  19769  20623  855  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002480971  normal  0.252127  normal  0.202912  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0215  CDS  NC_011884  20736  21377  642  Peroxidase  YP_002480972  normal  0.136957  normal  0.13257  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0216  CDS  NC_011884  21487  22395  909  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  YP_002480973  normal  0.0316575  normal  0.204344  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0217  CDS  NC_011884  22613  24034  1422  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  YP_002480974  normal  0.0294116  normal  0.15214  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0218  CDS  NC_011884  23982  25040  1059  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  YP_002480975  decreased coverage  0.00749598  normal  0.140739  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0219  CDS  NC_011884  25084  25215  132  hypothetical protein  YP_002480976  decreased coverage  0.00519278  normal  0.244302  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0220  CDS  NC_011884  25848  26033  186  Phycobilisome degradation protein nblA  YP_002480977  normal  0.0162293  normal  0.17421  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0221  CDS  NC_011884  26438  27196  759  protein serine/threonine phosphatase  YP_002480978  normal  0.0158982  normal  0.296252  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0222  CDS  NC_011884  27209  28924  1716  ABC-1 domain protein  YP_002480979  normal  0.164391  normal  0.703829  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0223  CDS  NC_011884  28982  29305  324  hypothetical protein  YP_002480980  normal  0.450955  normal  0.54427  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0224  CDS  NC_011884  29471  30262  792  hypothetical protein  YP_002480981  normal  0.926328  normal  0.430302  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0225  CDS  NC_011884  30409  31011  603  SUA5/yciO/yrdC domain protein  YP_002480982  normal  normal  0.424709  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0226  CDS  NC_011884  31043  31462  420  hypothetical protein  YP_002480983  normal  0.433444  normal  0.405209  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0227  CDS  NC_011884  31677  33434  1758  response regulator receiver protein  YP_002480984  normal  normal  0.531066  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0228  CDS  NC_011884  33620  34333  714  Rhomboid family protein  YP_002480985  normal  0.844894  normal  0.611688  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0229  CDS  NC_011884  34364  34852  489  pentapeptide repeat protein  YP_002480986  normal  normal  0.584528  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0230  CDS  NC_011884  34882  35310  429  7-cyano-7-deazaguanine reductase  YP_002480987  normal  0.477034  normal  0.782878  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0231  CDS  NC_011884  35361  35930  570  hypothetical protein  YP_002480988  normal  normal  0.780493  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0232  CDS  NC_011884  35933  37255  1323  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002480989  normal  normal  0.481146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0233  CDS  NC_011884  37282  37434  153  hypothetical protein  YP_002480990  normal  0.448155  normal  0.37323  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0234  CDS  NC_011884  37547  38479  933  Vitamin K epoxide reductase  YP_002480991  normal  normal  0.432417  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0235  CDS  NC_011884  38554  39408  855  photosystem I assembly BtpA  YP_002480992  normal  0.569155  normal  0.455637  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0236  CDS  NC_011884  39682  40185  504  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_002480993  normal  0.375059  normal  0.430302  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0237  CDS  NC_011884  40219  40770  552  NUDIX hydrolase  YP_002480994  normal  0.373824  normal  0.440739  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0238  CDS  NC_011884  40976  41590  615  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  YP_002480995  normal  0.282417  normal  0.598187  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0239  CDS  NC_011884  41906  43147  1242  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_002480996  normal  normal  0.713533  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0240  CDS  NC_011884  43635  43910  276  hypothetical protein  YP_002480997  normal  normal  0.649516  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0241  CDS  NC_011884  44090  45517  1428  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  YP_002480998  normal  normal  0.581458  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0242  CDS  NC_011884  45679  46257  579  hypothetical protein  YP_002480999  normal  normal  0.471208  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0243  CDS  NC_011884  46270  46881  612  hypothetical protein  YP_002481000  normal  normal  0.484753  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0244  CDS  NC_011884  46892  47332  441  hypothetical protein  YP_002481001  normal  normal  0.474623  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0245  CDS  NC_011884  47922  48107  186  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  YP_002481002  normal  normal  0.46685  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0246  CDS  NC_011884  48115  48777  663  Deoxyribonuclease V  YP_002481003  normal  normal  0.520455  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0247  CDS  NC_011884  48808  49476  669  protein of unknown function DUF205  YP_002481004  normal  normal  0.491401  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0248  CDS  NC_011884  49488  50489  1002  hypothetical protein  YP_002481005  normal  normal  0.250235  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0249  CDS  NC_011884  50542  50943  402  hypothetical protein  YP_002481006  normal  normal  0.21158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0250  CDS  NC_011884  51018  51764  747  protein of unknown function DUF140  YP_002481007  normal  normal  0.233193  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0251  CDS  NC_011884  51818  52378  561  hypothetical protein  YP_002481008  normal  normal  0.328814  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0252  CDS  NC_011884  52639  52911  273  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_002481009  normal  normal  0.313784  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0253    NC_011884  52997  55226  2230      normal  normal  0.315675  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0254  CDS  NC_011884  55267  56460  1194  sulfate adenylyltransferase  YP_002481010  normal  normal  0.249447  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0255  CDS  NC_011884  56688  57563  876  UspA domain protein  YP_002481011  normal  0.955091  normal  0.331109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0256  CDS  NC_011884  57589  59130  1542  serine/threonine protein kinase  YP_002481012  normal  0.457205  normal  0.272981  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0257  CDS  NC_011884  59489  59587  99  hypothetical protein  YP_002481013  normal  0.463572  normal  0.138658  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0258  CDS  NC_011884  59793  60176  384  transcriptional regulator, PadR-like family  YP_002481014  normal  0.630662  normal  0.0600002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0259  CDS  NC_011884  60279  60995  717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  YP_002481015  normal  0.382173  normal  0.0633983  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0260  CDS  NC_011884  61259  62722  1464  histidine kinase  YP_002481016  normal  0.205252  normal  0.0486545  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0261  CDS  NC_011884  62875  64227  1353  putative lipid-A-disaccharide synthase  YP_002481017  normal  0.504944  normal  0.0423311  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0262  CDS  NC_011884  64363  64965  603  Abortive infection protein  YP_002481018  normal  0.229896  normal  0.0175089  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0263  CDS  NC_011884  64979  65281  303  hypothetical protein  YP_002481019  normal  0.100527  normal  0.0153789  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0264  CDS  NC_011884  65441  66142  702  hypothetical protein  YP_002481020  normal  0.0832208  normal  0.0172457  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0265  CDS  NC_011884  66232  68250  2019  band 7 protein  YP_002481021  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0266  CDS  NC_011884  68344  69024  681  protein of unknown function DUF820  YP_002481022  unclonable  1.32368e-06  decreased coverage  0.00423088  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0267  CDS  NC_011884  69017  71641  2625  Radical SAM domain protein  YP_002481023  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0268    NC_011884  72022  72981  960      normal  0.914209  hitchhiker  0.00807661  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0269  CDS  NC_011884  73078  74022  945  metallophosphoesterase  YP_002481024  normal  decreased coverage  0.00378904  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0270  CDS  NC_011884  74089  74562  474  hypothetical protein  YP_002481025  normal  hitchhiker  0.00677549  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0271  CDS  NC_011884  74562  75836  1275  Polynucleotide adenylyltransferase region  YP_002481026  normal  hitchhiker  0.00875656  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0272  CDS  NC_011884  75911  76501  591  protein of unknown function DUF1001  YP_002481027  normal  normal  0.0133576  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0273  CDS  NC_011884  76661  77812  1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002481028  normal  normal  0.016409  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0274  CDS  NC_011884  78075  78284  210  TOBE domain protein  YP_002481029  normal  normal  0.0234749  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0275  CDS  NC_011884  78316  80166  1851  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002481030  normal  normal  0.0342756  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0276  CDS  NC_011884  80187  80981  795  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_002481031  normal  normal  0.0123729  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0277  CDS  NC_011884  81132  81602  471  TOBE domain protein  YP_002481032  normal  normal  0.0114044  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0278  CDS  NC_011884  81642  82790  1149  ABC transport protein, ATP-binding subunit  YP_002481033  normal  normal  0.0275531  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0279  CDS  NC_011884  82787  83395  609  hypothetical protein  YP_002481034  normal  normal  0.0230359  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0280  CDS  NC_011884  83434  84378  945  diguanylate cyclase with GAF sensor  YP_002481035  normal  normal  0.0265413  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0281  CDS  NC_011884  84546  85037  492  hypothetical protein  YP_002481036  normal  normal  0.0229241  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0282  CDS  NC_011884  85000  86310  1311  glutamine synthetase, type III  YP_002481037  normal  0.903176  normal  0.0152238  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0283  CDS  NC_011884  86332  87348  1017  hypothetical protein  YP_002481038  normal  0.99545  normal  0.0139101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0284  CDS  NC_011884  87345  88355  1011  fatty acid desaturase  YP_002481039  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0285  CDS  NC_011884  88623  88847  225  hypothetical protein  YP_002481040  normal  0.042498  decreased coverage  0.00235616  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0286  CDS  NC_011884  88844  89251  408  PilT protein domain protein  YP_002481041  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0287  CDS  NC_011884  89371  89829  459  ribosomal protein L9  YP_002481042  normal  0.0120134  normal  0.0123082  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0288  CDS  NC_011884  89856  93674  3819  replicative DNA helicase  YP_002481043  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0289  CDS  NC_011884  93823  94128  306  hypothetical protein  YP_002481044  hitchhiker  0.000309006  normal  0.0421929  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0290  CDS  NC_011884  94160  94309  150  hypothetical protein  YP_002481045  hitchhiker  0.000930295  normal  0.0410812  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0291  CDS  NC_011884  94347  94712  366  hypothetical protein  YP_002481046  hitchhiker  0.00138622  normal  0.0429545  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0292  CDS  NC_011884  94779  95054  276  hypothetical protein  YP_002481047  hitchhiker  0.00367665  normal  0.0437285  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0293  CDS  NC_011884  95058  95360  303  transcriptional regulator, LuxR family  YP_002481048  normal  0.0499337  normal  0.0433315  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0294  CDS  NC_011884  95460  97073  1614  GMP synthase  YP_002481049  normal  0.223502  normal  0.0574353  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0295  CDS  NC_011884  97107  98246  1140  cobalt-precorrin-6A synthase  YP_002481050  normal  normal  0.0309656  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0296  CDS  NC_011884  98407  98856  450  cyanate hydratase  YP_002481051  normal  normal  0.179303  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0297  CDS  NC_011884  98943  100361  1419  hemolysin-type calcium-binding region  YP_002481052  normal  normal  0.327634  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>