23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0272 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0272  protein of unknown function DUF1001  100 
 
 
196 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2579  hypothetical protein  70.92 
 
 
199 aa  300  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.755501  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2275  hypothetical protein  67.86 
 
 
198 aa  287  8e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3679  protein of unknown function DUF1001  65.98 
 
 
195 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5043  hypothetical protein  62.89 
 
 
195 aa  275  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.968769  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0800  hypothetical protein  62.89 
 
 
197 aa  265  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1417  protein of unknown function DUF1001  59.18 
 
 
196 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.83474  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1383  protein of unknown function DUF1001  58.67 
 
 
196 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4526  protein of unknown function DUF1001  46.28 
 
 
200 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.390851  normal  0.829315 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5722  protein of unknown function DUF1001  41.75 
 
 
204 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22311  CpeT  38.74 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0440  CpeT-like  37.76 
 
 
204 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.637972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0979  hypothetical protein  36.9 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0600583  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1887  CpeT-like  40.76 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0944089  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03371  hypothetical protein  34.41 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1910  hypothetical protein  34.69 
 
 
200 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0419  hypothetical protein  34.27 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0631886  normal  0.0277692 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5176  protein of unknown function DUF1001  31.19 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046678 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03901  CpeT  32.42 
 
 
199 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0448364  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1676  CpeT protein  32.42 
 
 
199 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0329357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4579  hypothetical protein  30.5 
 
 
198 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0772  hypothetical protein  33.85 
 
 
197 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.101942  normal  0.37279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2712  hypothetical protein  26.88 
 
 
354 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.334178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>