22 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Caul_0398  CDS  NC_010338  437644  438492  +  849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001682033  unclonable  0.0000000000000926955  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0602  CDS  NC_010338  664446  665294  +  849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001682233  unclonable  0.0000000000000351329  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1152  CDS  NC_010338  1217970  1220828  +  2859  conjugal transfer relaxase TraA  YP_001682780  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1153  CDS  NC_010338  1220838  1221539  +  702  hypothetical protein  YP_001682781  hitchhiker  0.00000000689091  unclonable  0.000000166393  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1154  CDS  NC_010338  1221685  1222278  +  594  hypothetical protein  YP_001682782  unclonable  0.0000000000000130498  unclonable  0.000000151962  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1155  CDS  NC_010338  1222275  1223102  +  828  putative transcriptional regulator  YP_001682783  hitchhiker  0.00000000163993  unclonable  0.000000164707  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1843  CDS  NC_010338  1960245  1963496  +  3252  TonB-dependent receptor  YP_001683470  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_2773  CDS  NC_010338  3012434  3012874  -  441  hypothetical protein  YP_001684398  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_2774  CDS  NC_010338  3012871  3013500  -  630  hypothetical protein  YP_001684399  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_2775  CDS  NC_010338  3013481  3014149  -  669  hypothetical protein  YP_001684400  unclonable  0.0000000000000196673  unclonable  0.000000169816  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3792  CDS  NC_010338  4109096  4109809  +  714  sugar fermentation stimulation protein A  YP_001685416  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3793  CDS  NC_010338  4109820  4110650  +  831  methionine aminopeptidase, type I  YP_001685417  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3794  CDS  NC_010338  4110754  4111344  +  591  DNA repair protein RadC  YP_001685418  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3795  CDS  NC_010338  4111503  4112744  +  1242  integrase family protein  YP_001685419  hitchhiker  0.000111159  unclonable  0.000000215958  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3796  CDS  NC_010338  4112741  4113160  +  420  hypothetical protein  YP_001685420  hitchhiker  0.000706753  unclonable  0.000000150422  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5080  CDS  NC_010335  184  1437  +  1254  peptidase S10 serine carboxypeptidase  YP_001676514  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5264  CDS  NC_010335  200164  200772  +  609  hypothetical protein  YP_001676698  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5265  CDS  NC_010335  200772  201818  +  1047  hypothetical protein  YP_001676699  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5266  CDS  NC_010335  202050  202319  +  270  hypothetical protein  YP_001676700  hitchhiker  0.0000581298  unclonable  0.0000163116  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5267  CDS  NC_010335  202307  203341  +  1035  hypothetical protein  YP_001676701  hitchhiker  0.00000517296  unclonable  0.0000225166  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5268  CDS  NC_010335  203344  203949  -  606  hypothetical protein  YP_001676702  hitchhiker  0.00000000066667  unclonable  0.0000199449  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5269  CDS  NC_010335  204546  209936  -  5391  hypothetical protein  YP_001676703  hitchhiker  0.00229781  unclonable  0.0000748398  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>