192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0084 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0084  putative transposase, truncation  100 
 
 		 62 aa  124  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.757347 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  96.77 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  96.77 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3045  ISPsy12, transposase OrfA  60.71 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.249443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  58.93 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  57.14 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  57.14 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  57.14 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  57.14 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  57.14 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  58.93 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  52.63 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  52.63 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  52.63 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4695  ISPsy13, transposase OrfA  57.14 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  54.72 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  55.36 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  50.91 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  50.91 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  50.91 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  53.57 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  49.12 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  50 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4765  transposase OrfA  50.91 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  43.55 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  48.21 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  51.79 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28850  hypothetical protein  51.79 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000267375  decreased coverage  0.000000000178046 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  50 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  51.79 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  51.79 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  51.79 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  51.79 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  51.79 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  51.79 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  51.79 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  51.79 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  51.79 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  51.79 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  46.77 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  39.68 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>