201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4695 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4695  ISPsy13, transposase OrfA  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  83.13 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  81.93 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  78.31 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  78.31 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  78.31 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  78.31 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  78.31 
 
 		 102 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  77.11 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  77.11 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  71.08 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  71.08 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  71.08 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  71.08 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  71.08 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  71.08 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  71.08 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  72.29 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  72.29 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  72.29 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  73.49 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  71.08 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2836  transposase IS3/IS911 family protein  67.53 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3045  ISPsy12, transposase OrfA  83.87 
 
 		 62 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.249443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  61.54 
 
 		 99 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28850  hypothetical protein  66.25 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000267375  decreased coverage  0.000000000178046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  58.11 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  55.84 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  50.6 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  50.6 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  50.6 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  54.88 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  54.88 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  54.88 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  51.95 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1373  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  43.37 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  43.37 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  49.35 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  49.35 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  49.35 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  49.35 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  49.35 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  46.99 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  44.16 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  44.16 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  44.16 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  48 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  45.45 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  46.75 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  45.45 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4797  hypothetical protein  77.08 
 
 		 48 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  48.05 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5033  IS911 transposase orfA  43.59 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  48.05 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  48.05 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  48.05 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  48.05 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  48.05 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  46.75 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0277  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0739  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3842  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  44.16 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>