49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2384 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2384  phage minor tail protein L  100 
 
 
250 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3099  phage minor tail protein L  97.6 
 
 
250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.221958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2223  phage minor tail protein L  69.6 
 
 
251 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2419  phage minor tail protein L  52.59 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3931  phage minor tail protein L  51.79 
 
 
249 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  50.2 
 
 
241 aa  264  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2778  Phage minor tail protein L  50.2 
 
 
249 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0268125  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2579  phage minor tail protein L  49.8 
 
 
241 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  47.79 
 
 
231 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  47.39 
 
 
231 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1694  phage HK022 GP18-like protein  46.22 
 
 
233 aa  221  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  44.67 
 
 
227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  45.08 
 
 
227 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  45.08 
 
 
227 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0446  phage minor tail protein  38.89 
 
 
272 aa  193  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0661  phage minor tail protein L  38.82 
 
 
234 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000371871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3385  phage minor tail protein L  39.68 
 
 
232 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126204  hitchhiker  0.0000000000973019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  38.86 
 
 
232 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  35.6 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1200  phage minor tail protein L  38.86 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  34.3 
 
 
232 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  34.3 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  34.3 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0705  phage minor tail protein L  34.47 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  33.88 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  33.88 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  39.13 
 
 
232 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  39.13 
 
 
232 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  37.31 
 
 
232 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  37.31 
 
 
232 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  37.31 
 
 
232 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2799  phage minor tail protein L  34.04 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145975  normal  0.513546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  37.82 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  40.7 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  37.5 
 
 
232 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  36.79 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  40.12 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0336216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  40.12 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  36.96 
 
 
232 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  36.96 
 
 
232 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5753  phage minor tail protein L  32.41 
 
 
243 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4060  phage minor tail protein L  32.02 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3530  phage minor tail protein L  31.89 
 
 
243 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3879  phage minor tail protein L  31.62 
 
 
243 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5050  phage minor tail protein L  31.62 
 
 
243 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7021  phage minor tail protein L  32.28 
 
 
243 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6225  phage minor tail protein L  29.37 
 
 
243 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  39.73 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1891  Phage-related protein-like  28.34 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0777557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>