48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5753 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5753  phage minor tail protein L  100 
 
 
243 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3879  phage minor tail protein L  98.77 
 
 
243 aa  500  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4060  phage minor tail protein L  98.35 
 
 
243 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5050  phage minor tail protein L  97.94 
 
 
243 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3530  phage minor tail protein L  97.53 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7021  phage minor tail protein L  88.07 
 
 
243 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6225  phage minor tail protein L  87.65 
 
 
243 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3385  phage minor tail protein L  32.92 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126204  hitchhiker  0.0000000000973019 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  31.78 
 
 
232 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1694  phage HK022 GP18-like protein  33.76 
 
 
233 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  34.71 
 
 
231 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  34.71 
 
 
231 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3099  phage minor tail protein L  32.94 
 
 
250 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.221958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  32.47 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  33.05 
 
 
227 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2384  phage minor tail protein L  32.41 
 
 
250 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  32.2 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  29.52 
 
 
232 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0661  phage minor tail protein L  29.26 
 
 
234 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000371871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  30.4 
 
 
232 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  30.4 
 
 
232 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  28.19 
 
 
232 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  29.07 
 
 
232 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  28.19 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2223  phage minor tail protein L  28.02 
 
 
251 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  27.73 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  27.73 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  29.96 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  30.14 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0336216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  30.14 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  30.14 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  27.73 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  27.73 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  28.63 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  28.63 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  28.63 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1200  phage minor tail protein L  27.63 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  27.31 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  26.61 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0446  phage minor tail protein  29.38 
 
 
272 aa  89  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2799  phage minor tail protein L  28.95 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145975  normal  0.513546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0705  phage minor tail protein L  28.95 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3931  phage minor tail protein L  27.73 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2419  phage minor tail protein L  28.12 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2778  Phage minor tail protein L  27.06 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0268125  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  26.72 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2579  phage minor tail protein L  26.32 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  35.79 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>