50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10051 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  100 
 
 
232 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  98.71 
 
 
232 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  98.71 
 
 
232 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  97.41 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1200  phage minor tail protein L  93.1 
 
 
232 aa  454  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  93.1 
 
 
232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  76.72 
 
 
232 aa  387  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  76.72 
 
 
232 aa  387  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  76.72 
 
 
232 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  76.72 
 
 
232 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  77.16 
 
 
232 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  76.72 
 
 
232 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  75.86 
 
 
232 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  76.29 
 
 
232 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  76.29 
 
 
232 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  76.29 
 
 
232 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2799  phage minor tail protein L  74.57 
 
 
232 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145975  normal  0.513546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0705  phage minor tail protein L  74.14 
 
 
232 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  66.67 
 
 
231 aa  344  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  66.67 
 
 
231 aa  343  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  66.67 
 
 
231 aa  343  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0336216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  72.26 
 
 
145 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0661  phage minor tail protein L  43.26 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000371871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  41.86 
 
 
227 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  41.9 
 
 
227 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  41.9 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  39.73 
 
 
232 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3385  phage minor tail protein L  39.15 
 
 
232 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126204  hitchhiker  0.0000000000973019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1694  phage HK022 GP18-like protein  38.22 
 
 
233 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  36.11 
 
 
231 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  35.65 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  35.22 
 
 
241 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3931  phage minor tail protein L  32.66 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3099  phage minor tail protein L  33.88 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.221958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2384  phage minor tail protein L  33.88 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2579  phage minor tail protein L  33.91 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2419  phage minor tail protein L  31.05 
 
 
249 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2778  Phage minor tail protein L  37.5 
 
 
249 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0268125  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2223  phage minor tail protein L  33.33 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0446  phage minor tail protein  34.45 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5050  phage minor tail protein L  28.15 
 
 
243 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5753  phage minor tail protein L  27.73 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3879  phage minor tail protein L  28.87 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4060  phage minor tail protein L  27.43 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6225  phage minor tail protein L  27.73 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7021  phage minor tail protein L  28.15 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3530  phage minor tail protein L  26.58 
 
 
243 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1891  Phage-related protein-like  29.3 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3496  hypothetical protein  23.96 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>