12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0138 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0138  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  160  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179023 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0052  hypothetical protein  67.53 
 
 
77 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.23275  hitchhiker  0.00952034 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0055  hypothetical protein  64.94 
 
 
77 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.506359 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0001  hypothetical protein  66.23 
 
 
77 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0067  hypothetical protein  62.34 
 
 
77 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3440  hypothetical protein  61.97 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3357  protein of unknown function DUF905  58.82 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3206  hypothetical protein  52.63 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3407  hypothetical protein  52.63 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4801  hypothetical protein  56.52 
 
 
49 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.623651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4683  hypothetical protein  50.98 
 
 
58 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4893  hypothetical protein  48.89 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>