12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3357 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3357  protein of unknown function DUF905  100 
 
 
79 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3407  hypothetical protein  61.97 
 
 
77 aa  104  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3206  hypothetical protein  61.97 
 
 
77 aa  104  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3440  hypothetical protein  61.64 
 
 
77 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0055  hypothetical protein  62.12 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.506359 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0138  hypothetical protein  58.82 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179023 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0052  hypothetical protein  59.09 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.23275  hitchhiker  0.00952034 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0001  hypothetical protein  57.58 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0067  hypothetical protein  56.06 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4683  hypothetical protein  55.56 
 
 
58 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4801  hypothetical protein  60.87 
 
 
49 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.623651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4893  hypothetical protein  57.45 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>