12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4683 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4683  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3407  hypothetical protein  91.38 
 
 
77 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3206  hypothetical protein  91.38 
 
 
77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4801  hypothetical protein  91.84 
 
 
49 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.623651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3357  protein of unknown function DUF905  55.56 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3440  hypothetical protein  51.79 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0055  hypothetical protein  55.36 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.506359 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0001  hypothetical protein  55.36 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0052  hypothetical protein  53.57 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.23275  hitchhiker  0.00952034 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0067  hypothetical protein  48.21 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0138  hypothetical protein  50.98 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4893  hypothetical protein  72.73 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>