12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3206 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3206  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3407  hypothetical protein  97.4 
 
 		 77 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4683  hypothetical protein  91.38 
 
 		 58 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3357  protein of unknown function DUF905  61.97 
 
 		 79 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4801  hypothetical protein  97.96 
 
 		 49 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623651 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3440  hypothetical protein  57.14 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4893  hypothetical protein  80.77 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0055  hypothetical protein  57.69 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506359 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0001  hypothetical protein  55.13 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0052  hypothetical protein  53.85 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.23275  hitchhiker  0.00952034 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0138  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179023 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0067  hypothetical protein  48.72 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>