12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0055 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0055  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506359 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0052  hypothetical protein  84.42 
 
 		 77 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.23275  hitchhiker  0.00952034 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0001  hypothetical protein  84.42 
 
 		 77 aa  140  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0067  hypothetical protein  80.52 
 
 		 77 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0138  hypothetical protein  64.94 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179023 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3357  protein of unknown function DUF905  62.12 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3407  hypothetical protein  57.69 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3440  hypothetical protein  61.97 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3206  hypothetical protein  57.69 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4683  hypothetical protein  55.36 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4893  hypothetical protein  63.64 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4801  hypothetical protein  58.33 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>