27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3993 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0223  hypothetical protein  86.24 
 
 		 411 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.75951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0234  viral enhancin protein  20.88 
 
 		 989 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3171  enhancin family protein  32.86 
 
 		 742 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000515499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3409  metallprotease, enhancin family  34.96 
 
 		 742 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3749  viral enhancin protein  31.16 
 
 		 856 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3393  metallprotease, enhancin family  31.65 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00436218  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0734  enhancing factor  33.06 
 
 		 851 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0100783  hitchhiker  0.00177255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0231  viral enhancin protein  35.34 
 
 		 1010 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3834  peptidase M60 viral enhancin protein  31.16 
 
 		 851 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3190  enhancin family protein  32.52 
 
 		 742 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.400731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3092  enhancin family protein  34.15 
 
 		 742 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0783379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3443  enhancin family protein  32.52 
 
 		 742 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1067 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  24.49 
 
 		 1068 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  26.88 
 
 		 869 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  27.33 
 
 		 749 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  22.62 
 
 		 735 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  23.85 
 
 		 1277 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  23.99 
 
 		 1475 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  23.39 
 
 		 1270 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  22.26 
 
 		 1476 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2868  glycosyl hydrolase  26.09 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.378735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4927  hypothetical protein  25.87 
 
 		 659 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  22.12 
 
 		 1467 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  26.57 
 
 		 660 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  23.5 
 
 		 1273 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>