35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1323 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1323  inhibitor of vertebrate lysozyme  100 
 
 		 169 aa  352  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3093  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  352  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00138636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1206  hypothetical protein  99.41 
 
 		 169 aa  350  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0470607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3576  inhibitor of vertebrate lysozyme  48.52 
 
 		 152 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13420  hypothetical protein  42.54 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.870374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1120  hypothetical protein  36.51 
 
 		 282 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1203  hypothetical protein  43.65 
 
 		 153 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1276  hypothetical protein  36.8 
 
 		 220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1544  hypothetical protein  36.8 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1127  hypothetical protein  36.8 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3047  hypothetical protein  36.8 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0982  hypothetical protein  36.8 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0043  hypothetical protein  39.84 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72360  hypothetical protein  39.66 
 
 		 155 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6279  hypothetical protein  39.66 
 
 		 155 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3024  hypothetical protein  38 
 
 		 100 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5091  inhibitor of vertebrate lysozyme  32.34 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0152765  normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0079  hypothetical protein  37.07 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0136  inhibitor of vertebrate lysozyme  36.75 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0260  hypothetical protein  39.02 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0152  inhibitor of vertebrate lysozyme  36.36 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0154  inhibitor of vertebrate lysozyme  35.9 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0330  hypothetical protein  38.21 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1125  Inhibitor of vertebrate lysozyme  35.04 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.342646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3400  C-lysozyme inhibitor  35.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00219  hypothetical protein  35.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0216  C-lysozyme inhibitor  35.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00215  inhibitor of vertebrate C-lysozyme  35.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0252  C-lysozyme inhibitor  35.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0248  C-lysozyme inhibitor  35.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0232  C-lysozyme inhibitor  39.53 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0959061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0264  C-lysozyme inhibitor  39.53 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.998632  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3387  Inhibitor of vertebrate lysozyme  39.53 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3623  C-lysozyme inhibitor  34.29 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2474  C-lysozyme inhibitor  28.95 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>