21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3623 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3623  C-lysozyme inhibitor  100 
 
 
189 aa  377  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2474  C-lysozyme inhibitor  50.85 
 
 
154 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812947  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3387  Inhibitor of vertebrate lysozyme  41.18 
 
 
148 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0264  C-lysozyme inhibitor  41.18 
 
 
149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.998632  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0232  C-lysozyme inhibitor  41.18 
 
 
149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0959061  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00219  hypothetical protein  41.18 
 
 
157 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00215  inhibitor of vertebrate C-lysozyme  41.18 
 
 
157 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0216  C-lysozyme inhibitor  41.18 
 
 
157 aa  111  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3400  C-lysozyme inhibitor  41.18 
 
 
157 aa  111  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0252  C-lysozyme inhibitor  41.18 
 
 
157 aa  111  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0248  C-lysozyme inhibitor  41.18 
 
 
157 aa  111  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1125  Inhibitor of vertebrate lysozyme  39.73 
 
 
148 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.342646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3576  inhibitor of vertebrate lysozyme  29.52 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1206  hypothetical protein  31.52 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3093  hypothetical protein  31.52 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00138636  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1323  inhibitor of vertebrate lysozyme  31.52 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3024  hypothetical protein  41.07 
 
 
100 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1544  hypothetical protein  38.6 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1127  hypothetical protein  38.6 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3047  hypothetical protein  38.6 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1120  hypothetical protein  38.6 
 
 
282 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>