19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0248 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0252  C-lysozyme inhibitor  100 
 
 
157 aa  326  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00219  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  326  7e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0216  C-lysozyme inhibitor  100 
 
 
157 aa  326  7e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3400  C-lysozyme inhibitor  100 
 
 
157 aa  326  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00215  inhibitor of vertebrate C-lysozyme  100 
 
 
157 aa  326  7e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0248  C-lysozyme inhibitor  100 
 
 
157 aa  326  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0232  C-lysozyme inhibitor  100 
 
 
149 aa  310  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0959061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0264  C-lysozyme inhibitor  100 
 
 
149 aa  310  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.998632  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3387  Inhibitor of vertebrate lysozyme  100 
 
 
148 aa  308  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2474  C-lysozyme inhibitor  49.6 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812947  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3623  C-lysozyme inhibitor  41.18 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1206  hypothetical protein  35.65 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3093  hypothetical protein  35.65 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00138636  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1323  inhibitor of vertebrate lysozyme  35.65 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3576  inhibitor of vertebrate lysozyme  30.34 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1125  Inhibitor of vertebrate lysozyme  26.5 
 
 
148 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.342646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6279  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72360  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289414  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0079  hypothetical protein  25.27 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>