36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1991 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1991  putative dehydratase  100 
 
 		 95 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2068  dehydratase  100 
 
 		 95 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03734  xanthomonadin biosynthesis dehydratase  55.79 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.56 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.48 
 
 		 565 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0479  acyl carrier protein dehydratase-like protein  47.62 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  34.95 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.73 
 
 		 569 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  35.96 
 
 		 580 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  37.14 
 
 		 609 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  37.14 
 
 		 609 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 593 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2747  hypothetical protein  36.84 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.168123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  33.33 
 
 		 590 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  33.33 
 
 		 590 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  38.24 
 
 		 584 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3103  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.77 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000492698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0818  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.13 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.768596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0763  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  34.67 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000366044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3020  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  34.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000176008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1380  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  36.11 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0733494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4174  hypothetical protein  34.48 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4758  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  36.11 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.12941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1937  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  33.33 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000779901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3970  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  31.88 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00469939  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0842  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.97 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3418  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.25 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01383  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.36 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00144652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0217  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  35.11 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3234  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.65 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000145526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2354  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.88 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2265  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  35.62 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1491  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  32.65 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00705821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3319  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  38.71 
 
 		 174 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2353  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  32.89 
 
 		 141 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0023817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>