16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0558 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0558  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  782    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000345423  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2002  hypothetical protein  61.89 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000203794  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1164  hypothetical protein  49 
 
 
351 aa  352  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10212  hitchhiker  0.00223915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0946  hypothetical protein  47.11 
 
 
351 aa  309  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3238  hypothetical protein  46.29 
 
 
353 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0332747  hitchhiker  0.000366296 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6599  hypothetical protein  43.32 
 
 
355 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000567082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2871  hypothetical protein  41.19 
 
 
351 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3658  hypothetical protein  36.03 
 
 
502 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2298  hypothetical protein  35.98 
 
 
503 aa  202  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
508 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235787  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0826  hypothetical protein  26.1 
 
 
497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0391252  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0146  hypothetical protein  26.1 
 
 
497 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1523  hypothetical protein  24.45 
 
 
497 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00190948 
 
 
-
 
NC_004310  BR0725  acetyltransferase  27.79 
 
 
511 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0717  acetyltransferase  27.79 
 
 
522 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0088  hypothetical protein  23.28 
 
 
525 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.191351  unclonable  0.0000123626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>