14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0088 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1060    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.191351  unclonable  0.0000123626 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1523  hypothetical protein  24.53 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00190948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0826  hypothetical protein  23.57 
 
 		 497 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0391252  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0146  hypothetical protein  23.46 
 
 		 497 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0725  acetyltransferase  27.27 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0717  acetyltransferase  27.05 
 
 		 522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3658  hypothetical protein  28.5 
 
 		 502 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2298  hypothetical protein  24.59 
 
 		 503 aa  91.3  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1164  hypothetical protein  25.32 
 
 		 351 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10212  hitchhiker  0.00223915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3238  hypothetical protein  24.85 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0332747  hitchhiker  0.000366296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0558  hypothetical protein  23.28 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000345423  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2002  hypothetical protein  24.5 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000203794  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0946  hypothetical protein  21.77 
 
 		 351 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>