17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0146 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0826  hypothetical protein  86.12 
 
 		 497 aa  862    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0391252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1523  hypothetical protein  82.9 
 
 		 497 aa  830    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00190948 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0146  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1006    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 		 508 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3658  hypothetical protein  27.48 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2298  hypothetical protein  26.59 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0088  hypothetical protein  23.15 
 
 		 525 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.191351  unclonable  0.0000123626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0558  hypothetical protein  26.1 
 
 		 381 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000345423  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1164  hypothetical protein  28.18 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10212  hitchhiker  0.00223915 
 
 
-
 
NC_004310  BR0725  acetyltransferase  23.3 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3238  hypothetical protein  28.37 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0332747  hitchhiker  0.000366296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2871  hypothetical protein  26.32 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0717  acetyltransferase  22.66 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6599  hypothetical protein  26.05 
 
 		 355 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000567082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0946  hypothetical protein  23.78 
 
 		 351 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2002  hypothetical protein  23.58 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000203794  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2300  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.711331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>