16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0826 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0826  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  999    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0391252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1523  hypothetical protein  81.69 
 
 
497 aa  831    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00190948 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0146  hypothetical protein  86.12 
 
 
497 aa  862    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
508 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235787  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3658  hypothetical protein  27.24 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2298  hypothetical protein  26.11 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0088  hypothetical protein  23.98 
 
 
525 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.191351  unclonable  0.0000123626 
 
 
-
 
NC_004310  BR0725  acetyltransferase  24.32 
 
 
511 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0558  hypothetical protein  26.1 
 
 
381 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000345423  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0717  acetyltransferase  24.13 
 
 
522 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1164  hypothetical protein  30.23 
 
 
351 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10212  hitchhiker  0.00223915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6599  hypothetical protein  24.84 
 
 
355 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000567082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2871  hypothetical protein  26.89 
 
 
351 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3238  hypothetical protein  27.81 
 
 
353 aa  101  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0332747  hitchhiker  0.000366296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0946  hypothetical protein  24.04 
 
 
351 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2002  hypothetical protein  23.76 
 
 
349 aa  97.8  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000203794  normal  0.107654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>