17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3011 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3011  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.349964  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1314  hypothetical protein  52.2 
 
 
300 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0508  hypothetical protein  38.71 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0331  hypothetical protein  32.13 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2614  hypothetical protein  41.26 
 
 
322 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752547  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0032  hypothetical protein  32.28 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0289  hypothetical protein  29.84 
 
 
409 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2665  hypothetical protein  30.95 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441412  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4010  hypothetical protein  27.27 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6735  hypothetical protein  26.47 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5329  hypothetical protein  33.75 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3130  hypothetical protein  26.35 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0233671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40 
 
 
263 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1329  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  23.66 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.233785  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3527  hypothetical protein  26.62 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1454  hypothetical protein  26.06 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.250223  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2657  hypothetical protein  27.03 
 
 
279 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.541783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>