16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4010 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4010  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  587  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2657  hypothetical protein  54.48 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6735  hypothetical protein  53.41 
 
 		 242 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3527  hypothetical protein  32.97 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4154  hypothetical protein  44.53 
 
 		 168 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.724646  normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0289  hypothetical protein  26.32 
 
 		 409 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0032  hypothetical protein  27.91 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1314  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2665  hypothetical protein  30.15 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1454  hypothetical protein  29.31 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.250223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2614  hypothetical protein  31.5 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19000  hypothetical protein  32.85 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0721077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0508  hypothetical protein  27.07 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1329  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.15 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.233785  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3011  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.349964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0331  hypothetical protein  27.03 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>