23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1314 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2614  hypothetical protein  37 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1454  hypothetical protein  36.58 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.250223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3011  hypothetical protein  52.2 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.349964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0508  hypothetical protein  46.88 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0006  hypothetical protein  46.38 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0008  hypothetical protein  46.38 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0509  hypothetical protein  41.61 
 
 		 432 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0886  hypothetical protein  40.6 
 
 		 452 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0660  hypothetical protein  39.86 
 
 		 424 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0331  hypothetical protein  37.59 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0289  hypothetical protein  30.16 
 
 		 409 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0032  hypothetical protein  35.48 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4010  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2665  hypothetical protein  31.9 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6735  hypothetical protein  27.08 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2657  hypothetical protein  27.08 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3527  hypothetical protein  27.61 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1329  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  27.34 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.233785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6925  hypothetical protein  30.71 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4154  hypothetical protein  25.83 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.724646  normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0807  hypothetical protein  30.71 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0966  hypothetical protein  30.71 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>