16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6735 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6735  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4010  hypothetical protein  53.41 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2657  hypothetical protein  50.61 
 
 		 279 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4154  hypothetical protein  41.38 
 
 		 168 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.724646  normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3527  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0289  hypothetical protein  30.43 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2665  hypothetical protein  30.82 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0032  hypothetical protein  30.53 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1314  hypothetical protein  27.08 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0508  hypothetical protein  26.87 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19000  hypothetical protein  30.28 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0721077 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1329  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  27.86 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.233785  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3011  hypothetical protein  26.47 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.349964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2614  hypothetical protein  23.67 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0331  hypothetical protein  26.49 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1454  hypothetical protein  23.08 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.250223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>