17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1117 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1117  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
152 aa  290  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3077  flagellar export protein FliJ  48.65 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3803  flagellar export protein FliJ  49.32 
 
 
154 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4391  flagellar export protein FliJ  47.52 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0642  flagellar export protein FliJ  36.55 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0554  flagellar export FliJ  37.14 
 
 
155 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1020  flagellar export protein FliJ  34.41 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0569  flagellar biosynthesis chaperone  39.71 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  29.01 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  29.52 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0394  flagellar protein  29.17 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137594  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  28.57 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1349  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.39 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  29.01 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  28.57 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  29.17 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  29.17 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>