More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4334 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4334  adenylylsulfate kinase  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1816  adenylylsulfate kinase  56.36 
 
 
200 aa  191  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0637  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
204 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2799  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
204 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2912  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
206 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2676  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
206 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1690  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
206 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2733  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
206 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.57754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2375  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
206 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2481  adenylylsulfate kinase  56.1 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0313  adenylylsulfate kinase  48.8 
 
 
203 aa  175  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1085  adenylylsulfate kinase  52.73 
 
 
216 aa  175  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257987  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1758  Adenylyl-sulfate kinase  54.88 
 
 
179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3519  adenylate sulfate kinase protein  48.84 
 
 
209 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01194  Adenylyl-sulfate kinase (EC 2.7.1.25)(Adenosine-5'-phosphosulfate kinase)(APS kinase)(ATP adenosine-5'-phosphosulfate 3'-phosphotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92203]  49.71 
 
 
206 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9629  sulfate adenylate transferase subunit 1  50 
 
 
636 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2350  adenylyl-sulfate kinase  46.15 
 
 
199 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.745  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2100  adenylylsulfate kinase  48.8 
 
 
214 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  48.8 
 
 
207 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2619  adenylylsulfate kinase  53.14 
 
 
236 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0739  adenylylsulfate kinase  50.93 
 
 
207 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  48.8 
 
 
211 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  53.33 
 
 
645 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  48.8 
 
 
207 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1028  adenylylsulfate kinase  53.14 
 
 
283 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  48.26 
 
 
614 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5557  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
222 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  50.9 
 
 
642 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  49.4 
 
 
604 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  48.8 
 
 
214 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  47.62 
 
 
638 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  49.4 
 
 
638 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0166  adenylylsulfate kinase  52.8 
 
 
205 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  47.27 
 
 
201 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1099  adenylyl-sulfate kinase  46.34 
 
 
195 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1650  adenylylsulfate kinase  45 
 
 
198 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0334  adenylyl-sulfate kinase  48.15 
 
 
195 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0153  adenylylsulfate kinase  53.14 
 
 
236 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  45.71 
 
 
644 aa  165  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16180  Adenylylsulfate kinase  48.82 
 
 
197 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.732852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2332  adenylyl-sulfate kinase  49.1 
 
 
219 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0456568  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  50.3 
 
 
198 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2763  adenylylsulfate kinase  53.14 
 
 
236 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2338  adenylyl-sulfate kinase  49.4 
 
 
227 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00543558  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0177  adenylylsulfate kinase  53.14 
 
 
283 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1322  adenylylsulfate kinase  53.14 
 
 
283 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  46.39 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  49.11 
 
 
647 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  49.7 
 
 
640 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0637  adenylylsulfate kinase  49.7 
 
 
211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  44.51 
 
 
651 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1363  adenylyl-sulfate kinase  50.3 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0248  adenylyl-sulfate kinase  51.5 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.5 
 
 
633 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  52.5 
 
 
641 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1425  adenylyl-sulfate kinase  47.88 
 
 
209 aa  162  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.403059  normal  0.0845056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.81 
 
 
640 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0864  adenylylsulfate kinase  46.24 
 
 
207 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1689  adenylyl-sulfate kinase  46.71 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664653  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5471  adenylylsulfate kinase  50.31 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0134651  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2576  adenylylsulfate kinase  45.2 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  46.67 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  47.31 
 
 
633 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3593  sulfate adenylyltransferase, large subunit  50.61 
 
 
617 aa  161  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.876759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0038  adenylylsulfate kinase  47.56 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1319  sulfate adenylyltransferase, large subunit  49.03 
 
 
621 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.692528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0299  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3998  adenylylsulfate kinase  49.39 
 
 
181 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1952  adenylylsulfate kinase  52.15 
 
 
497 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4040  adenylylsulfate kinase  49.39 
 
 
181 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1346  adenylyl-sulfate kinase  45.78 
 
 
197 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22650  Adenylyl-sulfate kinase  46.34 
 
 
185 aa  161  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24694  adenylylsulfate kinase  49.06 
 
 
201 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  46.67 
 
 
203 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2204  adenylylsulfate kinase  48.19 
 
 
203 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0201  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  45.81 
 
 
644 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987097  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0303  adenylylsulfate kinase  51.52 
 
 
187 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0637  adenylylsulfate kinase  44.85 
 
 
197 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3184  adenylylsulfate kinase  47.02 
 
 
207 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1145  adenylyl-sulfate kinase  45.78 
 
 
197 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0786  adenylyl-sulfate kinase  51.52 
 
 
187 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01831  adenylylsulfate kinase  46.06 
 
 
217 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.573546  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4709  adenylylsulfate kinase  49.4 
 
 
196 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01951  adenylylsulfate kinase  45.45 
 
 
208 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3191  adenylyl-sulfate kinase  49.41 
 
 
228 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.942826  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0962  adenylylsulfate kinase  48.5 
 
 
205 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2622  adenylylsulfate kinase  44 
 
 
199 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0591419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5380  adenylylsulfate kinase  49.09 
 
 
180 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0800  adenylyl-sulfate kinase  45.24 
 
 
210 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000729878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0833  adenylylsulfate kinase  46.75 
 
 
204 aa  158  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  47.34 
 
 
619 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  47.34 
 
 
619 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5895  adenylyl-sulfate kinase  55.41 
 
 
201 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851674  normal  0.0986241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  47.34 
 
 
619 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1305  adenylylsulfate kinase  44.58 
 
 
197 aa  157  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  47.27 
 
 
639 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0070  sulfate adenylyltransferase, large subunit  47.9 
 
 
652 aa  157  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.972692  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2957  adenylyl-sulfate kinase  43.02 
 
 
228 aa  157  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3866  adenylylsulfate kinase  45.18 
 
 
203 aa  157  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1514  adenylylsulfate kinase  44.58 
 
 
197 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000229121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>