More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2957 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2957  adenylyl-sulfate kinase  100 
 
 
228 aa  474  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2985  adenylyl-sulfate kinase  87.16 
 
 
223 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.879711  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1689  adenylyl-sulfate kinase  81.94 
 
 
222 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664653  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0800  adenylyl-sulfate kinase  75.7 
 
 
210 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000729878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1425  adenylyl-sulfate kinase  76.06 
 
 
209 aa  330  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.403059  normal  0.0845056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2145  adenylylsulfate kinase  66.34 
 
 
209 aa  291  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  61.11 
 
 
638 aa  261  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  59.7 
 
 
201 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  60 
 
 
198 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  59.7 
 
 
203 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2204  adenylylsulfate kinase  57.14 
 
 
203 aa  252  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2622  adenylylsulfate kinase  58.46 
 
 
199 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0591419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3345  Adenylyl-sulfate kinase  58.33 
 
 
203 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0820  adenylyl-sulfate kinase  59.31 
 
 
209 aa  245  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1584  adenylylsulfate kinase  59.5 
 
 
197 aa  245  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1546  adenylylsulfate kinase  59.5 
 
 
197 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1306  adenylylsulfate kinase  59.5 
 
 
197 aa  244  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1305  adenylylsulfate kinase  59.5 
 
 
197 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  59.11 
 
 
212 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1478  adenylylsulfate kinase  59 
 
 
197 aa  244  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  59.18 
 
 
644 aa  243  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3866  adenylylsulfate kinase  59.5 
 
 
203 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1346  adenylyl-sulfate kinase  59 
 
 
197 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  57.92 
 
 
631 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1332  adenylylsulfate kinase  61.03 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1442  adenylylsulfate kinase  61.03 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1514  adenylylsulfate kinase  61.03 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000229121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1145  adenylyl-sulfate kinase  59 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02714  adenylylsulfate kinase  58.79 
 
 
198 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02600  adenylylsulfate kinase  59.69 
 
 
201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0938  Adenylyl-sulfate kinase  59.69 
 
 
201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4002  adenylylsulfate kinase  59.69 
 
 
201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3051  adenylylsulfate kinase  59.69 
 
 
201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.256539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2888  adenylylsulfate kinase  59.69 
 
 
201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02565  hypothetical protein  59.69 
 
 
201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2876  adenylylsulfate kinase  59.69 
 
 
201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.878793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2136  adenylylsulfate kinase  55.5 
 
 
199 aa  241  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00619163  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  57.92 
 
 
199 aa  241  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0939  adenylylsulfate kinase  56.22 
 
 
208 aa  240  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0313  adenylylsulfate kinase  56.93 
 
 
203 aa  240  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1650  adenylylsulfate kinase  56.72 
 
 
198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0962  adenylylsulfate kinase  59.18 
 
 
201 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.510912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1363  adenylyl-sulfate kinase  52.48 
 
 
204 aa  238  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3124  adenylylsulfate kinase  59.18 
 
 
201 aa  238  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  56.63 
 
 
633 aa  238  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  54.17 
 
 
214 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0967  adenylylsulfate kinase  58.25 
 
 
213 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3058  adenylylsulfate kinase  58.25 
 
 
201 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3123  adenylylsulfate kinase  58.25 
 
 
201 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3084  adenylylsulfate kinase  58.25 
 
 
201 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3243  adenylylsulfate kinase  58.25 
 
 
201 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3434  adenylylsulfate kinase  58.25 
 
 
234 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3139  adenylylsulfate kinase  58.25 
 
 
201 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.476768  normal  0.15294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3302  adenylylsulfate kinase  57.73 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2135  adenylylsulfate kinase  58.16 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1319  sulfate adenylyltransferase, large subunit  60.56 
 
 
621 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.692528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02135  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.61 
 
 
598 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  53.81 
 
 
638 aa  232  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3221  adenylylsulfate kinase  57.73 
 
 
201 aa  232  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  52.88 
 
 
207 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27091  adenylylsulfate kinase  57.65 
 
 
227 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0903  adenylylsulfate kinase  56.19 
 
 
205 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0866  adenylylsulfate kinase  54.23 
 
 
205 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3359  adenylylsulfate kinase  58.55 
 
 
205 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  54.5 
 
 
651 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3516  adenylylsulfate kinase  58.03 
 
 
205 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.1 
 
 
640 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0666  adenylylsulfate kinase  56.22 
 
 
205 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3069  adenylylsulfate kinase  55.67 
 
 
205 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2100  adenylylsulfate kinase  55.45 
 
 
214 aa  228  5e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  53.62 
 
 
207 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  52.68 
 
 
201 aa  228  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0299  adenylylsulfate kinase  54.08 
 
 
225 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0194  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  52.88 
 
 
644 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0986259  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  55.15 
 
 
614 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  54.64 
 
 
208 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  53.14 
 
 
211 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0186  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  52.88 
 
 
644 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0471725  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3519  adenylate sulfate kinase protein  55.44 
 
 
209 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.57 
 
 
633 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  54.68 
 
 
640 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  54.04 
 
 
198 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02401  adenylylsulfate kinase  54.9 
 
 
212 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  52.74 
 
 
640 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  54.68 
 
 
642 aa  224  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2482  adenylylsulfate kinase  53.23 
 
 
212 aa  224  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.288285  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.06 
 
 
633 aa  224  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01951  adenylylsulfate kinase  55.15 
 
 
208 aa  224  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00500  Adenylylsulfate kinase, C-terminal domain protein  52.24 
 
 
198 aa  224  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413176  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0864  adenylylsulfate kinase  54.82 
 
 
207 aa  224  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0774  adenylyl-sulfate kinase  56.19 
 
 
196 aa  224  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.294704  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3723  adenylylsulfate kinase  55.15 
 
 
205 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1533  adenylylsulfate kinase  54.41 
 
 
212 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3405  adenylylsulfate kinase  54.12 
 
 
205 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0931  adenylylsulfate kinase  54.64 
 
 
205 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  61.36 
 
 
639 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0957  adenylylsulfate kinase  54.64 
 
 
205 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.57 
 
 
640 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0833  adenylylsulfate kinase  55.96 
 
 
204 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0637  adenylylsulfate kinase  53 
 
 
211 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>