23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3839 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3839  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  150  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3342  hypothetical protein  82.89 
 
 		 76 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0421  hypothetical protein  79.1 
 
 		 91 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5363  hypothetical protein  74.29 
 
 		 70 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4816  hypothetical protein  74.29 
 
 		 70 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1990  hypothetical protein  73.91 
 
 		 69 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666976  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3961  hypothetical protein  73.91 
 
 		 69 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.777885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3537  hypothetical protein  77.61 
 
 		 69 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.120714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0179  hypothetical protein  72.86 
 
 		 70 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5387  hypothetical protein  71.43 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5474  hypothetical protein  71.43 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387175  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4795  hypothetical protein  71.43 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3311  hypothetical protein  70 
 
 		 70 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13455  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_003296  RS04788  hypothetical protein  66.2 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0838812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0635  hypothetical protein  73.02 
 
 		 64 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4006  hypothetical protein  64.79 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4119  hypothetical protein  64.79 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5789  hypothetical protein  68.25 
 
 		 64 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1079  hypothetical protein  72.41 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132852  normal  0.282307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2736  hypothetical protein  70 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3455  hypothetical protein  59.68 
 
 		 64 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6211  hypothetical protein  51.56 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0027  hypothetical protein  42.65 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0608014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>