23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5789 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5789  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0635  hypothetical protein  78.12 
 
 		 64 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5363  hypothetical protein  69.84 
 
 		 70 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4816  hypothetical protein  69.84 
 
 		 70 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3537  hypothetical protein  73.02 
 
 		 69 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.120714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3961  hypothetical protein  71.43 
 
 		 69 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.777885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0421  hypothetical protein  73.02 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1990  hypothetical protein  69.84 
 
 		 69 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666976  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_003296  RS04788  hypothetical protein  69.84 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0838812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3311  hypothetical protein  68.25 
 
 		 70 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13455  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5474  hypothetical protein  65.62 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387175  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4795  hypothetical protein  65.62 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5387  hypothetical protein  65.62 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3839  hypothetical protein  68.25 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0179  hypothetical protein  64.06 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213602 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4006  hypothetical protein  64.52 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4119  hypothetical protein  64.52 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3342  hypothetical protein  65.08 
 
 		 76 aa  95.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1079  hypothetical protein  71.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132852  normal  0.282307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3455  hypothetical protein  53.12 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2736  hypothetical protein  65.08 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6211  hypothetical protein  50.79 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0027  hypothetical protein  50.85 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0608014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>