24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1079 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132852  normal  0.282307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3839  hypothetical protein  72.41 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0635  hypothetical protein  69.49 
 
 		 64 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5363  hypothetical protein  67.8 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4816  hypothetical protein  67.8 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5789  hypothetical protein  71.19 
 
 		 64 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3342  hypothetical protein  67.24 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3961  hypothetical protein  67.8 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.777885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0421  hypothetical protein  70.18 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1990  hypothetical protein  67.24 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666976  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3537  hypothetical protein  66.1 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.120714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4119  hypothetical protein  64.41 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4006  hypothetical protein  64.41 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04788  hypothetical protein  62.71 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0838812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0179  hypothetical protein  62.71 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4795  hypothetical protein  61.02 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5474  hypothetical protein  61.02 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387175  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5387  hypothetical protein  61.02 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3311  hypothetical protein  61.02 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13455  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3455  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6211  hypothetical protein  55 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0027  hypothetical protein  51.67 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0608014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2736  hypothetical protein  55.93 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2679  hypothetical protein  36.84 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0285865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>