23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0421 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0421  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3537  hypothetical protein  97.1 
 
 
69 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.120714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5363  hypothetical protein  79.41 
 
 
70 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4816  hypothetical protein  79.41 
 
 
70 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3961  hypothetical protein  77.94 
 
 
69 aa  120  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.777885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3839  hypothetical protein  79.1 
 
 
73 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4795  hypothetical protein  75 
 
 
70 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5387  hypothetical protein  75 
 
 
70 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5474  hypothetical protein  75 
 
 
70 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387175  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3311  hypothetical protein  75 
 
 
70 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13455  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1990  hypothetical protein  76.12 
 
 
69 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666976  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0179  hypothetical protein  75 
 
 
70 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213602 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4006  hypothetical protein  73.53 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4119  hypothetical protein  73.53 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04788  hypothetical protein  72.06 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0838812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3342  hypothetical protein  72.46 
 
 
76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00247266  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0635  hypothetical protein  74.6 
 
 
64 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5789  hypothetical protein  73.02 
 
 
64 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2736  hypothetical protein  75.36 
 
 
70 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3455  hypothetical protein  64.52 
 
 
64 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1079  hypothetical protein  70.18 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132852  normal  0.282307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6211  hypothetical protein  57.81 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119215  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0027  hypothetical protein  50.85 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0608014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>