16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2861 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2861  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  620  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0241  hypothetical protein  43.21 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3503  hypothetical protein  41.05 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0433937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6816  hypothetical protein  34.85 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21130  putative outer membrane lipoprotein  33.76 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1802  putative lipoprotein  32.48 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6629  hypothetical protein  36.49 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452924  normal  0.113875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0101  hypothetical protein  27.38 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3280  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1270  hypothetical protein  33.85 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000179578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3080  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4240  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3332  putative outer membrane lipoprotein  30 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.111957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3324  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.35841  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3248  putative outer membrane lipoprotein  29.17 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3429  putative outer membrane lipoprotein  29.17 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>