14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1270 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1270  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000179578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0101  hypothetical protein  59.04 
 
 
259 aa  329  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3503  hypothetical protein  34.36 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0433937  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0241  hypothetical protein  31.05 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2861  hypothetical protein  34.09 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6629  hypothetical protein  36.45 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452924  normal  0.113875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6816  hypothetical protein  28.8 
 
 
329 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21130  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109681  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1802  putative lipoprotein  32.52 
 
 
242 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3280  putative lipoprotein  30.6 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3080  putative lipoprotein  30.6 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4240  putative lipoprotein  30.6 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3248  putative outer membrane lipoprotein  28.45 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3429  putative outer membrane lipoprotein  28.45 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>